Dynamic Hotstring實例

之前在「自己寫武功祕笈：Radiologist的第一個Autohotkey」提到一點dynamic hotstring的使用，這篇再介紹幾個實用範例。

Prerequisite

• Regular expression：雖然看起來像火星文但真得很重要（自行覆頌三遍），可參「Regular Expression入門」
• AutoHotkey_L：一般而言用Unicode 32-bit
• Dynamic hotstring的library：AutoHotkey的論壇上可以找到幾種版本，我用的是比較多選項的這個版本
• 下載Hotstring.ahk存到AutoHotkey主程式資料夾內的Lib資料夾，或者ahk檔資料夾內的Lib資料夾（詳見說明）
• ahk檔開頭加上#include <Hotstring>
• 自訂的hotstring是以函數方式執行，所以要放在auto-execute section內，簡單來說就是在第一個return之前的範圍

 範例1：日期

• 輸入：8個數字，再加上一個分隔字元，例如20151218/
  輸出：2015/12/18

#include <hotstring><br /> sendmode, input<br /> <br /> hotstring("i)\b(\d{8})(\/|\.|\-)","date",3) <br /> ; 第一個submatch為8個數字，第二個submatch為分隔字元，有三種選擇（/ . -），trigger的subroutine是date，第三個選項的3表示用regular expression<br /> return <br /> <br /> date:<br /> dateStr:=$.value(1) ; 第一個submatch<br /> delim:=$.value(2) ; 第二個submatch<br /> <br /> send % substr(dateStr,1,4) delim substr(dateStr,5,2) delim substr(dateStr,7,2)<br /> ; substr(date,1,4)表示data字串第1個字元開始的4個字元，也就是年份<br /> return

 範例2：檢查部位

• 輸入：不定部位的字母代號，加上without/with contrast enhancement數字代號，以及一個結尾符號，例如b1=
  輸出：CT of the brain without contrast enhancement shows:

#include <hotstring><br /> sendmode, input<br /> <br /> hotstring("i)(b?n?c?a?p?d?t?l?u?v?)(\d)=","examTitle",3)<br /> <br /> ; 以bncapdtluv依序代表brain, neck, chest, abdomen, pelvic, C/T/L-spine, upper/lower extremity，並建立一個對應array<br /> examTitle:={ b: "brain", n: "neck", c: "chest", a: "abdomen", p: "pelvis", d: "C-spine", t: "T-spine", l: "L-spine", u: "upper extremity", v: "lower extremity"}<br /> <br /> ;數字代號0, 1, 2表示CT的∓C, -C, +C，3, 4, 5表示MRI<br /> <br /> return<br /> <br /> <br /> examTitle:<br /> examTitleStr:=$.value(1)<br /> code:=$.value(2)<br /> <br /> exam:= (code<3?"CT":"MRI") " of the " ; code小於3是CT<br /> contrast:= " " (mod(code,3)=0?"without/with":mod(code,3)=1?"without":"with") " contrast enhancement shows: `n- "<br /> <br /> loop,parse,examTitleStr  ; 分析每個字元<br />     exam.=examTitle[a_loopfield] ", "   ; 加上對應的部位<br /> <br /> send % substr(exam,1,-2) contrast<br /> ; substr(exam,1,-2)表示從exam字串的第1個字元開始，忽略最後2個字元（因為最後有多餘的, ）<br /> return

範例3：lines and tubes for CXR

• 輸入：數個字母代號，加上結尾符號，例如tgv=
  輸出：Placement of endotracheal tube, nasoenteric tube, central venous catheter(s).

#include <hotstring><br /> sendmode, input<br /> <br /> hotstring("i)([a-z]+)=","lineTube",3)<br /> ; 建立各字母對應的array，請自行增加並記憶！<br /> lineTube:={ t: "endotracheal tube", g: "nasoenteric tube", v: "central venous catheter(s)" }<br /> <br /> return<br /> <br /> lineTube:<br /> code:=$.value(1)<br /> str:="Placement of "<br /> <br /> loop,parse,code<br /> <span style="color: yellow;">    </span>str.=lineTube[a_loopfield] ", "<br /> <br /> send % substr(str,1,-2) "."<br /> return

醫病溝通

根本就是平行世界。大部分時候只是醫生覺得病人懂了自己講的，病人也覺得懂了醫生講的，其實是各自腦補。

今天第一次參加這種面對面溝通，雖然主要是針對一線的醫師，但也會做到procedure的敝科也無法置身事外。簡而言之就是常見的劇本：病人因為碰到一連串的事件不幸掛了，家屬不能接受，列出某些不滿意的事項（通常都是小缺失），質疑如果沒有這些小事件，是不是就不會有今天的結果。當然，「人好好的進醫院，怎麼會變這樣」的經典台詞也出現。幾個簡單心得如下：

• 大部分人「不理性」， 更何況是剛遭遇那麼重大的事件。同樣的質疑點一提再提，不知道是不接受還是聽不進去，或是瞬間就忘了，一直鬼打牆似的對話重播。大概就是問了A，回答A，有可能還沒回答完又突然想到質疑B，回答B後換C，C回答後又回到A，講半天完全沒進度沒共識。

• 大部分人無法被「告知」、無法「理解」、更不用說「記住」專業的知識。以前說什麼要「告知同意」，但病人/家屬絕對不可能理解100%，甚至可能是「-100%」，也就是完全誤解。再加上記憶力是有限的而且不可靠，事後醫生說他講過，但家屬覺得沒講過，各說各話，沒錄音根本沒證據，只能說還好簽同意書已經是routine。

• 承上點，除了沒有專業的知識，有些完全錯誤的知識反而根深諦固，例如沒看過急性中風，質疑為什麼30分鐘前人是好的，見面時就發作，「哪有那麼巧的」；醫院冷氣那麼冷，害人身體變虛，害人感染；「再觀察」就是沒在治療，「保守治療」就是沒有盡力治療。不勝枚舉，只能說還好這些觀念在法庭上沒有什麼威脅…

• 大部分人無法注意到「醫療上」會影響病人的因素，只能把注意力放在「醫療外」的枝微末節，但覺得是這些細節影響了預後。這部分大概是最難想像、最難掌握的，護理師不經意的一個動作（沒有蓋被子）、某位醫師（包括大P或菜鳥）隨口的病情評估（這一定好起來/好不起來），反而記得一清二楚，連那個人長得胖瘦高矮都記著，總之就是各種服務不周到。有些人希望醫生講越多越詳細越好，做個手術可能會死可能會植物人是基本的，各種替代治療不管對病人是好是壞都要知道；有些人反而不敢聽那麼多，聽越多越怕，覺得不吉利；反正怎樣都能怪。

• 大部分人沒有benefit/risk的概念，不知道在不同狀況下會有不同的考慮，沒有標準答案，也不是SOP。可能遇到的說詞是：為什麼某個(侵入性)治療要「拖」緊急時才做，不能提早做，不能「預防」嗎？侵入性治療一定兼有benefit/risk，沒有適應症甚至有禁忌症的狀況下，risk₁ > benefit₁，整體效益可能benefit₁ - risk₁ - cost < 0；但在危急狀況下，不做治療的risk嚴重許多，不治療效益是 - BigRISK，治療的效益是benefit₂ - risk₂ - cost，所以有可能要治療。注意benefit₁不一定等於benefit₂，risk₁也不一定等於risk₂；而且，在危急狀況當下，很可能不治療或治療的效益都是負的，只能「兩害相權取其輕」。隨著各專科專業化，有時候連不同科醫生間也會吵起來，互相思考不周，只看到人家某種治療的benefit，卻沒去了解相關的risk，或者反之。

行醫生涯，很難不會越來越保守，尤其是還很菜的時候… 大家常說的一句話是「還沒踢到鐵板，只是做得不夠多」。在踢到鐵板前，前輩們會叮嚀先穿好鐵鞋，雖然鐵鞋會造成某種程度的不便（例如別人覺得你效率低落），但為了防止踢到鐵板，確實是智慧的傳承，是一種自己人才知道的，benefit/risk之間巧妙的平衡。

Triangulation of mammography

所謂的breast lesion的triangulation，是說MLO或CC其中一張看到lesion，但另一個view不確定在哪，則再照ML。如果（相對breast中軸）的距離，ML比MLO高，則lesion在medial side，反之則在lateral side。可參考這篇paper或是這張小小示意圖。

以數學表示之：

• 以nipple為原點之極座標系，假設lesion在(r, θ)，θ = 0表示正上方，θ = π/2表示lateral，θ = -π/2表示medial。如果直角座標系則是(r sinθ, r cosθ)
• 於是lesion在ML時高度為r cosθ，在CC時為r sinθ。事實上，對於某φ角度（原點及方向同θ）之造影，lesion高度為r cos(θ-φ)。
• 對cos(θ-φ)作圖，θ from -π to π表示lesion從medial到lateral，φ from 0 to π/2表示從ML到CC，Z軸表示lesion高度，如圖。
• 直接看contour plot，medial lesion也就是t from -π to 0的部分，在p from 0 to π/2也就是ML到CC，顏色變深也就是值變小；lateral lesion也就是t from 0 to π則相反。大致上正確。
• 仔細想發現不對呀，就cos(θ-φ)而言，for any θ from -π to π，在φ from 0 to π/2並不一定是嚴格遞增或遞減，例如一個lesion在θ ＝ π/8處，則ML排到CC的高度應該像這張圖。
• 因此結論是：原始敘述並不完全正確，而且lesion在各個view間的關係並不在「直線」上，而是在cos曲線上。

新天鵝堡拼圖

四月底去德國時，在新天鵝堡買了2000片的拼圖，前幾個月進度緩慢，反而這幾個禮拜準備考試，念書累了拼一下，終於在今天完成！！

以前很少拼圖，那麼多片也是第一次（小時候看舅舅拼1500就拼很久了），在拼之前還特別google看別人怎麼拼。雖然不是老手，但拼完總是有些心得：

• 找一塊空地/空桌規劃為拼圖區，要做好長期抗戰的準備。不能只預留拼圖的完成大小，因為零散的一塊塊拼圖會佔更多空間。
• 找一塊夠大的紙板（例如攤平的紙箱）當作底，素色面朝上，拼到一半要拍照留念比較美觀。
• 找一些小紙盒，或是有凹槽的保麗龍（買家電時在紙箱內的），分類用。
• 拼圖分類：
• 找邊：最重要的邊緣先分出來！！
• 依顏色區分，例如最醒目的紅色，建築的米白、天藍、雪白、黑色
• 左上的樹是失焦的部分，對應的是糊糊的拼圖片
• 斑駁色，包括兩邊下方的藍黑斑駁色、右邊超多樹枝區、背景細密樹林、不是很純白的白色（遠方雪山、左下積雪等）
• 剛開始先拼建築，也就是紅色和米色的部分
• 有些屋頂的雪可能會被歸到雪白類
• 被樹枝覆蓋，或是和背景相接處，在分類時可能也歸在不同的地方。倒也不用特地去找。
• 接下來是失焦的樹，但模糊的拼圖片看起來都很像，拼不順利。拼到一半先換兩邊下方的陰暗樹林。
• 右邊樹枝是最耗眼力的部分，有鑑於東湊西湊太費時（一堆樹枝、雪塊、葉子都差不多），於是出動Radiologist大絕，直接在原圖找絕對位置，然後放到紙板上大概的位置！當然還是有些小技巧
• 對原圖時最重要的是方向要對，例如雪會在樹枝之上、陰影在樹枝之下、雪塊的上半是較完整的圓弧、根據背景的顏色可以猜在上方還是下方
• 無法猜方向就只能四個方向都找，找的時候先盯著拼圖片，記住一些特徵，例如樹枝交叉的角度、雪塊的形狀、一塊特別形狀的陰影之類的。
• 因為和原圖比還是有色差，有時候先在紙板上已定位好的拼圖片比較，猜測大致的位置
• 原圖是相對比較小的，最好有個比例尺可以時時參考，例如已知拼好的某一雪塊的長度大概是拼圖片的大小，這樣對於手上這片的目標物大小比較有概念。
• 拼到七、八成以上，就不一定要對原圖，常常在半成品上比對一下就能找到位置，通常是老婆的工作，我繼續比對原圖
• 有了右邊樹枝的經驗，左邊的樹就容易多了，建築下方及左方的部分也是用類似的方法完成。
• 背景的細密樹林、遠山、天空、左下雪地則由老婆完成！
• 找時間再去雷諾瓦裱框。

結論：相輔相成的兩個技巧就是「找原圖絕對座標法」以及「鄰近片拼湊法」，優缺點大致剛好相反：

• 前者耗眼力，但一旦找到就可當作已拼上，一次找一片，不需要額外的空間放置散落的拼圖片。因為原圖和拼圖有色差、比例的問題，有時候找起來沒那麼容易。
• 後者在拼圖片數目太多時嚴重影響效率，而且需要額外的空間，通常要再依色澤、明暗度 分成幾個subgroup。優點是不需要分辨上下左右，拼起來就是了。拼圖片的大小寬窄、特殊片（全凸、全凹、三凸、三凹）也提供線索。

另外也找到新天鵝堡的3D拼圖，發現小時候好像拼過，真是有緣！

Structure of AutoHotkey Script

開始上工打報告，除了看說明檔學AHK的語法、函數，有些程式撰寫的概念是在說明檔學不到的，身為業餘工程師(?)分享一些用血淚(?)堆出的心得～

單一檔案

• 大概是老師輩比較常用的，攜帶方便，一個ahk檔和一個AutoHotkey.exe主檔就可以到處帶著走，不管電腦有沒有安裝AutoHotkey，或是電腦內AutoHotkey版本不一樣，只要把ahk檔拖曳到主檔就好了。
• 老師輩的AHK大部分是以字母順序排序，而且hotstring以全部大寫設定
• 優點：管理方便，搜尋快速（人眼搜尋就很快了）
• 缺點：
• 只有hotstring字母按順序，送出string沒什麼順序，明明是相似的內容（例如left、right）但彼此距離很遠。
• 重複的string可能分給不同的hotstring而不自知。
• CWY老師的script雖然是字母排列，但是兼顧系統分類，例如：
• 「J」開頭通常是joint →  JGH 是glenohumeral joint
• 「B」開頭是bone的某個部分 →  BFI 是femoral intertrochanteric region
• 「Q」開頭指的是某個方位 →  QP 是posterior aspect。

多個檔案

• 最近幾屆的學長姐開始區分不同用途的script，通常有一個打plain film，有一個打CT/MR，根據group可能再多一個打特殊檢查例如mammography。
• 優缺點大致和單一檔案的情形相反：
• 優點：
• 各script所用的hotstring可以重複，同樣是「C0」，可以設定為Chest X-ray的normal report，也可以設定為Chest CT的normal template。
• script內的hotstring較少，效能較好（影響不大），比較不會因為電腦lag出現使string延遲送出
• 缺點：
• 需要切換script，當然，通常打報告時會集中打同一種類的檢查，再打另一種類的檢查，並不如想像中要一直切換（除了值班時急診報告？）
• 管理不易，有些通用hotstring要在每一個script都寫一次，例如 L 是left，R 是right，不論是哪一種報告的script都需要

樹狀結構

• 學弟妹接觸AHK較多，開始會用樹狀結構，把某些hotstring寫在main.ahk，再各自有CT.ahk、CXR.ahk之類的，然後include main.ahk，大致也是我用的方法但底下會再細談
• 優點和上一個類似，新增的優點是有main.ahk可以寫通用的hotstring
• 缺點就是複雜，如果加上一堆hotkey、function、subroutine，因為AHK先天不嚴格的語言結構，有時候很難找到出錯的地方，debug不易。但如果每個script都是純粹的hotstring/string pairs，樹狀結構其實是最好的。

Some Tips

• 我的script架構是樹狀，基本上就像其他程式語言的library一樣，分工合作！
• 因為hotstring的數量不會太影響效能，所以原則上是能縮寫就縮寫，從word、phrase、sentence到paragraph，只要用縮寫就是會比較快！（當然，要記憶的hotstring較多）
• 基於歷史因素，因為resident時打最多的是急診CT，main.ahk就包括general term以及CT/MR會用到的片語/句子/範本
• 在script中以用途/部位分類：
• history/title：哪幾個部位的CT、有沒有打顯影劑，事實上這部位是以dynamic hotstring去送出字串。
• 方位：上下左右內外深淺，及搭配「aspect of」
• 一般字詞：thickening, wall thickening, fat stranding, stenosis, narrowing之類的都有設定hotstring
• 輔助詞：把finding串接成句子/不完整句的一些輔助詞，例如there is, is suspected, is noted, suggestive of, probably, showing, causing, nature to be determined之類的
• 各部位：brain, neck, chest, body, MSK, intervention
• 在各個部分，剛開始以字母排序但後來就隨意了，反正有Hotstring Helper可以查詢，不需要用Ctrl + F找
• 通常hotstring以「1」結尾代表名詞複數，例如::nd::nodule，則:*:nd1::nodules，加星號表示不用ending character。但在形容詞/動詞則是詞性變化，例如::enl::enlarged, :*:enl1::enlargement；::sig::significant, :*:sig1::significantly。
• 用數字也可以代表程度，例如brain atrophy、leukoaraiosis的罐頭敘述
• 基本上hotstring以2個或3個字母為主，因為排列組合後其實很夠用，最最最常用的才是1個字母，不常用的或是template可用到4個字母。為了避免重複，以子音決定所用的hotstring。
• 其他一些dynamic hotstring也會在main.ahk設定，為了避免dynamic hotstring和一般的hotstring相衝突，dynamic hotstring常以特殊字元結尾當作trigger（例如 =, /）
• Plain film的ahk以CXR, KUB, MSK plain film為主，然後在最後一行include main.ahk
• main.ahk裡的auto-execute section無法被執行（函數的定義還會在），所以需要用到的dynamic hotstring需要在plain film重新寫入。
• 如果有重複的function、subroutine名稱會出錯，考慮加上namespace的概念，例如main_func和plain_func以區分。
• hotstring是先搶先贏制，所以plain film中的hotstring會優先於最後一行include進來的main.ahk。例如::ll::left lung，則main.ahk的::ll::on the left side就沒作用
• Hotkey無法重複定義，但如果用dynamic hotkey則可以啟動、停止、覆蓋舊的hotkey
• 在確認報告(F3)時，會check報告內容（plain film報告不分段）再送出
• 句首字母大寫
• 兩個以上的點「..」變成一個點「.」：打報告時以「.」來觸發hotstring（雖然沒有證據證明，但我覺得按空白鍵觸發比較容易在string還沒全部送出前就穿插在句子中間）
• 「.,」變成「,」：需要補充句子（例如要加上more on the right side.）則以「,」觸發hotstring
• 如果有三個字母/數字就接著句點，表示hotstring打錯或是沒觸發，出現提醒。
• 打plain film時，active的視窗是PACS還是可以按F3送出報告。
• 因為plain film有時候會爆量打不完，所以hotstring要盡量用1-2個字母，就像嘸蝦米輸入法一樣，一碼/兩碼都有對應的字（雖然很多要死背）。
• 另外還有mammography的ahk
• 一旦發現有字詞沒有hotstring一定要馬上新增，不能偷懶！
• 少用到的字母如Z, X, Y, Q等都可以用來當hotstring，例如前面提到的Q當作某個aspect（記法：Quadrant）、Z當作和某個檢查/臨床correlation（記法：coRRelation）的敘述